| Namn | EU-ID | Vatten | Huvudavrinningsomr. | ||
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Abbekås | SE613400-136070 | Del av Arkonahavets utsjövatten | Havet | |
| 2 | Abiskojaure | SE758208-161749 | Abiskojaure | Torneälven | |
| 3 | Allgjuttern | SE642489-151724 | Allgjuttern | Botorpsströmmen | |
| 4 | Bolmen | SE629511-136866 | Bolmen | Lagan | |
| 5 | Brännträsket | SE728095-175926 | Brännträsket | ||
| 6 | Bysjön | SE658086-130264 | Bysjön | Göta älv | |
| 7 | Byxelkrok | SE636580-157150 | Del av V Gotlandshavets utsjövatten | Havet | |
| 8 | Bästeträsk | SE642555-168553 | Bästeträsk | Kustområde | |
| 9 | Deep Trench | SE642611-276793 | Del av Skagerraks utsjövatten | Havet | |
| 10 | Degervattnet | SE708512-152086 | Degervattnet | Ångermanälven | |
| 11 | E Landsort Deep | SE650908-694601 | Del av V Gotlandshavets utsjövatten | Havet | |
| 12 | Fiolen | SE633025-142267 | Fiolen | Mörrumsån | |
| 13 | Fjällbacka | SE651010-123620 | Fjällbacka inre skärgård | Havet | |
| 14 | Fladen | SE635110-126000 | Del av Kattegatts utsjövatten | Havet | |
| 15 | Fysingen | SE660749-161885 | Fysingen | Norrström | |
| 16 | Gaviksfjärden | SE700510-164280 | Gaviksfjärden | Havet | |
| 17 | Gotland So | SE630890-167260 | Del av Ö Gotlandshavets utsjövatten | Havet | |
| 18 | Harufjärden | SE729360-181720 | Norrbottens skärgårds kustvatten | Havet | |
| 19 | Hjärtsjön | SE632515-146675 | Hjärtsjön | Alsterån | |
| 20 | Holmöarna | SE707355-175080 | N n Kvarkens kustvatten | Havet | |
| 21 | Kinnbäcksfjärden | SE720490-175920 | Kinnbäcksfjärden | Havet | |
| 22 | Krageholmssjön | SE615375-137087 | Krageholmssjön | Kustområde | |
| 23 | Krankesjön | SE617797-135339 | Krankesjön | Kävlingeån | |
| 24 | Kullen | SE624940-128820 | Del av Kattegatts utsjövatten | Havet | |
| 25 | Kvädöfjärden | SE643000-155000 | Kvädöfjärden | Havet | |
| 26 | Lagnö | SE659340-166010 | Svartlögafjärden | Havet | |
| 27 | Landsort | SE651030-163110 | Del av V Gotlandshavets utsjövatten | Havet | |
| 28 | Limmingsjön | SE660804-142742 | Limmingssjön | Göta älv | |
| 29 | Långvindsfjärden 22017 | SE685220-158710 | Långvindsfjärden | Havet | |
| 30 | Nidingen | SE635970-126500 | N m Hallands kustvatten | Havet | |
| 31 | Remmarsjön | SE708619-162132 | Remmarsjön | Gideälven | |
| 32 | Rånefjärden | SE731090-180270 | Gussöfjärden | Havet | |
| 33 | Spjutsjön 1 | SE672467-148031 | Spjutsjön | Dalälven | |
| 34 | Stensjön | SE683673-154083 | Stensjön | Ljusnan | |
| 35 | Stora Envättern | SE655587-158869 | Stora Envättern | Trosaån | |
| 36 | Stora Karlsö | SE635280-163150 | V Gotlands s kustvatten | Havet | |
| 37 | Stora Skärsjön | SE628606-133205 | Stora Skärsjön | Genevadsån | |
| 38 | Stor-Backsjön | SE695220-143383 | Stor-Backsjön | ||
| 39 | Stor-Björsjön | SE706083-132287 | Stor-Björsjön | ||
| 40 | Stor-Tjulträsket | SE731799-151196 | Stor-Tjulträsket | ||
| 41 | Storvindeln | SE728960-156080 | Storvindeln | Umeälven | |
| 42 | Sännen | SE624421-147234 | Sännen | ||
| 43 | Tärnan | SE660688-164478 | Tärnan | Kustområde | |
| 44 | Utlängan | SE620290-149890 | Del av Hanöbuktens utsjövatten | Havet | |
| 45 | Väderöarna | SE649860-121420 | Del av Skagerraks utsjövatten | Havet | |
| 46 | Västra Hanöbukten | SE618170-140460 | Del av Hanöbuktens utsjövatten | Havet | |
| 47 | Åland Deep | SE667964-724318 | Del av N Ålands havs utsjövatten | Havet | |
| 48 | Ängskärsklubb | SE673670-161260 | Öregrundsgrepen | Havet | |
| 49 | Örefjärden | SE703990-167930 | Örefjärden | Havet | |
| 50 | Övre Skärsjön | SE663532-148571 | Övre Skärsjön | Norrström | |